B Pandoc
B.1 Introducción
Pandoc es un conversor de documentos libre y de código abierto, Pandoc puede leer archivos en distintos formatos, incluyendo:
Puede convertir los documentos de entrada a muchos otros formatos, incluyendo Office Open XML, OpenDocument, HTML, Wiki markup, InDesign ICML, ebooks, OPML, y varios formatos basados en TeX (desde donde se puede producir un PDF). En la web oficial https://pandoc.org hay un listado completo de los formatos soportados. Pandoc también proporciona distintas extensiones de Markdown para que admita resultados más complejos.
Pandoc es una herramienta independiente de línea de comandos (sin interfaz gráfica), que se instala automáticamente con RStudio porque el paquete rmarkdown la emplea para generar los documentos de salida a partir de documentos Markdown (por ejemplo, en Windows en C:\Program Files\RStudio\bin\pandoc\pandoc.exe).
B.2 Conversión de documentos con Pandoc
La sintaxis del comando es pandoc [opciones] [ficheros]. Si se ejecuta pandoc --help, en la ventana de comandos o en la pestaña Terminal de RStudio, se obtiene un listado detallado de las opciones. También se puede consultar el manual de Pandoc https://pandoc.org/MANUAL.html.
Si Pandoc no está configurado en la ruta de búsqueda, habrá que reemplazar pandoc por la ruta completa al ejecutable. Por ejemplo, para emplear la versión instalada con RStudio en Windows habra que introducir "C:\Program Files\RStudio\bin\pandoc\pandoc".
Podemos emplear Pandoc para convertir contenido escrito en otros formatos a Markdown, por ejemplo:
Un fichero word a markdown
"C:\Program Files\RStudio\bin\pandoc\pandoc" fichero.docx -f docx -t markdown --extract-media . -o fichero.RmdUn fichero LaTeX a markdown
"C:\Program Files\RStudio\bin\pandoc\pandoc" fichero.tex -f latex -t markdown -o fichero.RmdUna web a markdown
"C:\Program Files\RStudio\bin\pandoc\pandoc" http://url.org -f html -t markdown -o fichero.Rmd
Por defecto pandoc produce en algunos casos un fragmento de documento (cuando el formato de salida no es markdown). Para obtener un documento independiente (e.g. un fichero HTML válido incluyendo <head> y <body>), habrá que emplear la opción -s o --standalone.
B.3 Pandoc y RMarkdown
Como ya se comentó, el paquete rmarkdown llama a pandoc para renderizar un documento RMarkdown11, y esta llamada se muestra en la consola (o en la correspondiente pestaña de RStudio):
"C:/Program Files/RStudio/bin/pandoc/pandoc" +RTS -K512m -RTS Informes.utf8.md --to html4
--from markdown+autolink_bare_uris+ascii_identifiers+tex_math_single_backslash
--output Informes.html --smart --email-obfuscation none --self-contained --standalone
--section-divs --table-of-contents --toc-depth 3 --variable toc_float=1
--variable toc_selectors=h1,h2,h3 --variable toc_collapsed=1 --variable toc_smooth_scroll=1
--variable toc_print=1 --template "C:\PROGRA~1\R\R-35~1.1\library\RMARKD~1\rmd\h\DEFAUL~1.HTM"
--no-highlight --variable highlightjs=1 --variable "theme:bootstrap" --include-in-header
"C:\Users\RUBEN~1.FCA\AppData\Local\Temp\RtmpkntXD8\rmarkdown-str2084caf51da.html" --mathjax
--variable "mathjax-url:https://mathjax.rstudio.com/latest/MathJax.js?config=TeX-AMS-MML_HTMLorMML"
Output created: Informes.htmlLa mayoría de los campos de la cabecera YAML de un fichero RMarkdown se traducen en las opciones de Pandoc. Por ejemplo, la cabezera:
---
output:
html_document:
number_sections: yes
---(que produce la numeración de secciones y subsecciones), se corresponde con la opción --number-sections de pandoc. También se puede establecer cualquier opción de Pandoc en la cabecera YAML mediante el campo pandoc_args, por ejemplo:
---
output:
html_document:
pandoc_args: ["--number-offset", "4,0", "--number-sections"]
---(en este caso la numeración comenzaría en 4).